7月3日,傳感器技術領域國際權威期刊Sensors and Actuators B: Chemical(中科院一區,影響因子8.0)在線發表了我院教師王佩博士的研究論文“A highly sensitive on-site duplex genotyping method dRPG for simultaneous detection of SARS-CoV‑2 key mutations with single nucleotide resolution”。
基因分型是确定可能導緻生物表型重大變化的基因差異的技術,已成為核酸檢測的重要組成部分。目前已有的基因分型檢測方法包括DNA測序、質譜、分子信标、微陣列和基于PCR的方法等,這些方法精确、靈敏且特異,但依賴于實驗室設備和專業人員,限制了基因分型技術在現場檢測中的廣泛應用。另一方面,多重檢測能力是對基因分型檢測技術的一個關鍵要求,這是由于在大多數情況下,通過一系列基因位點的變異分析才能确定一個有意義的基因分型結果。在本研究中,我院教師王佩博士利用來源于激烈火球菌的Argonaute蛋白(PfAgo)的高度特異性識别能力和多靶标區分能力,與核酸等溫擴增技術重組聚合酶擴增(RPA)相結合,建立了一種新型雙重基因分型方法,稱為雙重RPA-PfAgo基因分型法(dRPG)。該方法實現了對新冠病毒兩個關鍵突變位點L452R和E484Q的同時檢測,且達到了單核苷酸差異的分辨率。該研究首次将PfAgo與RPA結合應用于新冠病毒的多突變位點檢測,能滿足現場檢測中對準确性、靈敏度和簡易性要求,可有效應用于對新冠病毒突變的長期追蹤,且為精準醫學、分子育種、病原檢測和食品安全領域中重要核酸靶标的現場多重基因分型檢測提供了新的技術路徑。
該論文的第一完成單位是伟德官网下app官方网站,我院教師王佩博士為該論文的通訊作者。論文的合作單位還包括江蘇海洋大學和南京師範大學。該論文的研究得到了國家自然科學基金和中國博士後科學基金等項目的支持。
原文鍊接:
Chenjie Zhao, Yixin Tang, Miao Xu, Yue Wang, Bo Luo, Pei Wang, Song Gao. A highly sensitive on-site duplex genotyping method dRPG for simultaneous detection of SARS-CoV‑2 key mutations with single nucleotide resolution. Sensors and Actuators B: Chemical, 2024, 418, 136238. https://doi.org/10.1016/j.snb.2024.136238.